MeRIP-seq
N6-methyladenosine 也叫 m6A,是一種廣泛存在于 mRNA 上的堿基修飾行為,是近幾年大熱的研究方向。
目前科學家已經(jīng)在 RNA 中鑒定了超過 100 種不同類型的堿基修飾行為。mRNA 最常見的內部修飾包括 N6- 腺苷酸甲基化(m6A)、N1- 腺苷酸甲基化(m1A)、胞嘧啶羥基化(m5C)等。截止當前,全球的科學家已經(jīng)鑒定了參與 m6A 的許多酶,包括去甲基化酶、甲基化酶和甲基化識別酶等。
技術路線
樣本要求
組織濕重:推薦800mg起,心肝脾>腦肺腎>骨
細胞樣本:推薦5x10的7次方起
總RNA量:total RNA>200ug,mRNA約為10-30ug起
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