ATAC-seq
定義：
ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）是使用高通量測序?qū)?/span>Tn5轉(zhuǎn)座酶易接近性染色質(zhì)區(qū)域進行測序分析的一種表觀遺傳學研究技術。
該技術有兩大特點：（1）轉(zhuǎn)座酶只對開放染色質(zhì)區(qū)域進行切割；（2）轉(zhuǎn)座酶可以同時對切割下來的DNA片段的兩端添加測序接頭。
實驗原理和方法：
（1）收集細胞或組織，制備細胞懸液；
（2）加入細胞膜裂解液，獲得細胞核；
（3）加入Tn5轉(zhuǎn)座酶，對處于開放狀態(tài)的DNA進行酶切；
（4）回收酶切下來的DNA片段，PCR擴增后進行二代高通量測序。
測序參數(shù)：illumina/BGI平臺，6G
應用方向：
1. 染色質(zhì)開放性圖譜繪制，注釋全基因組調(diào)控元件；
2. 預測參與調(diào)控生物學過程的轉(zhuǎn)錄因子；
結果示例：
（1）全基因組開放性區(qū)域圖譜分析
不同樣本間基因活性調(diào)控序列圖譜
（2）motif分析預測轉(zhuǎn)錄因子結合蛋白
（3）ATAC-seq與RNA-seq聯(lián)合分析
基因結構開放狀態(tài)與基因表達水平關聯(lián)分析
樣本準備：
18162769638
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